Ako se u sintezi alkil poliglikozida koriste masni alkoholi koji sadrže 16 ili više atoma ugljika po molekuli, dobiveni produkt je topiv u vodi samo pri vrlo niskim koncentracijama, tipično DP od 1,2 do 2. U nastavku se nazivaju u vodi netopljivi alkil poliglikozidi. Među ovim alkil poliglikozidima dominantna su nepolarna svojstva zbog dugog alkilnog lanca. Oni se ne koriste kao površinski aktivne tvari, već se prvenstveno koriste kao emulgatori u kozmetičkim formulacijama.
Promatrana reakcija glukoze s dodekanolima/tetradekanolima uvelike je primjenjiva na sintezu u vodi netopljivih alkil poliglikozida, kao što su cetil/oktadecil poliglikozidi. Reakcije katalizirane kiselinom odvijaju se pri sličnim temperaturama, pritiscima i molarnim omjerima između sirovina. Međutim, zbog njihove niske topivosti, te je proizvode teže pročišćavati i izbjeljivati ​​kao paste na bazi vode. Važno je proizvesti proizvode s niskim sadržajem i svijetlom bojom neposredno nakon koraka reakcije, čime se izbjegava daljnja obrada.
Najvažniji neželjeni nusprodukt je poliglukoza. Ona je žućkastosmeđe boje i zbog toga značajno kvari boju. Osim toga, prisutnost visokih koncentracija poliglukoze otežava koncentriranje reakcijske smjese destilacijom, jer se poliglukoza vrlo brzo raspada kako temperatura raste. To u konačnici također narušava svojstva izvedbe.
Budući da se brzina stvaranja polidekstroze značajno povećava pred kraj reakcije, reakcija prerano završava na oko 80% konverzije glukoze snižavanjem temperature i neutraliziranjem katalizatora. Kako bi se osigurala ujednačena i ponovljiva kvaliteta proizvoda, koristi se online analiza za točno praćenje transformacije. Pri prekidu, neizreagirana glukoza je prisutna kao suspendirana krutina i može se lako ukloniti naknadnom filtracijom. Nakon uklanjanja glukoze, proizvod sadrži približno 1-2q polidekstroze, koja je emulgirana u vrlo sitnim kapljicama. Odabirom odgovarajućeg pomoćnog sredstva za filtriranje, polidekstroza se može potpuno ukloniti u drugom koraku filtriranja.
Ovim se postupkom dobiva proizvod koji uglavnom ne sadrži glikozu i polidekstrozu i sadrži 15 do 30% dugolančanih (C 16/18) alkil poliglikozida i 85 do 70% masnog alkohola (C16/18-OH). Budući da proizvod ima povišeno talište, obično se prodaje kao krutina u obliku pahuljica ili peleta.
Visoke razine dugolančanih alkohola su prihvatljive jer mnogi kozmetički losioni sadrže velike količine istog alkohola. Stoga se alkil poliglikozidi mogu izravno koristiti kao alkil poliglikozidi/masni alkoholi.
Relativno novije vrste alkil poliglikozida netopivih u vodi sadrže oko 500% alkil poliglikozida i 500% masnih alkohola. U ovom slučaju, dio masnog alkohola uklanja se vakuumskom destilacijom, a termičko raspadanje se suzbija održavanjem temperature i vremena zadržavanja što je moguće niže. (Slika 7) Ova vrsta koncentriranog proizvoda uvelike proširuje raspon primjene u vodi netopljivih alkil poliglikozida.